Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M11F6U8V3 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M11F6U8V3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms