Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms