Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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