Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms