Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc83Q9D4V3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms