Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms