Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc28aQ8CEI3 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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