Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc38Q8CDN8 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms