Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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