Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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