Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms