Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14283-201ENSMUST00000119763 325 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 H2-M10.5-ps1-201ENSMUST00000174378 939 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4823-201ENSMUST00000181990 984 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2076-201ENSMUST00000182524 971 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tssk4-207ENSMUST00000228395 1273 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sbp-201ENSMUST00000024940 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Zg16-201ENSMUST00000051122 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb3-201ENSMUST00000054650 781 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr545-201ENSMUST00000058750 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem19-204ENSMUST00000217887 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4b-205ENSMUST00000106904 2430 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd19-201ENSMUST00000063071 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33023-202ENSMUST00000212450 1571 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gsdmc2-201ENSMUST00000089900 1981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cflar-201ENSMUST00000069333 3163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1gds1-205ENSMUST00000196280 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpk-201ENSMUST00000043269 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hps1-202ENSMUST00000069298 3196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms