Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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