Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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