Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Pkp1P97350 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Pkp1P97350 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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