Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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