Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms