Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VimP20152 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VimP20152 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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