Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P20040 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P20040 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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