Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms