Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21900J3QP38 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms