Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Smim18J3QNP2 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms