Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cldn34c3J3QJW5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms