Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Hdac6Q9Z2V5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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