Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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