Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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