Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Smg9Q9DB90 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Smg9Q9DB90 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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