Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pramef12Q9D2F1 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms