Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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