Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms