Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg4aQ8C9S8 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Atg4aQ8C9S8 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms