Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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