Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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