Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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