Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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