Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms