Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps27aP62983 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps27aP62983 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms