Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms