Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms