Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtpraP18052 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtpraP18052 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtpraP18052 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms