Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms