Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms