Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hdac5Q9Z2V6 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms