Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms