Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms