Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms