Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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