Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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