Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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