Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms